СУ „Никола Вапцаров“ участва активно в национални и европейски проекти за модерна образователна среда.
Проект „Заедно в различията си чрез десегрегация“ — изпълнява се в партньорство между три образователни институции от общините Силистра и Тутракан. СУ „Никола Й. Вапцаров“ е партньор 1. Целта е да се насърчи образователната десегрегация и да се преодолеят предрасъдъци и негативни нагласи, чрез съвместни мероприятия, обмен на опит и обучения за училищната общност.
Проект „Изграждане на училищна STEM среда и ВОСКС“ (BG-RRP-1.015-1050). По проекта са изградени 6 високотехнологични свързани класни стаи (ВОСКС) с мултитъч дисплеи, лаптопи, графични таблети и камери, както и STEM център от три кабинета в направленията „Природни науки“ и „Математика и информатика“. Общата стойност на проекта е близо 360 000 лв.
През 2023/2024 и 2024/2025 г. училището работи по проекта. Сформирани са групи за допълнителна подкрепа на деца със СОП и хронични заболявания. Оборудван е нов кабинет за училищния психолог, а в училище работят и двама помощник-учители, които подпомагат социализацията и обучението на деца със специални образователни потребности.
През 2021–2022 г. по проекта са получени общо 74 лаптопа за ученици и учители и универсален шкаф за зареждане. Техниката се ползва в периодите на обучение от разстояние в електронна среда.
През 2020–2021 г. училището работи по „Подкрепа за успех“ (19 групи за допълнително обучение, 152 ученици) и „Образование за утрешния ден“. Изпълнени са и проекти за квалификация на педагогическите специалисти.
Създадена е интерактивна площадка за обучение по безопасност на движението по пътищата — вътрешна и външна, с оборудване и материали за пълноценни учебни часове.
Съвместно с LightSource Charity (от 2017/2018 г.) училището стана по-позитивно, цветно и уютно. През лятото на 2018 г. са обновени 20 класни стаи, зали и помещения; следва втори етап през 2019 г. Проектът залага на доброволчеството и екипната работа на учители, родители и ученици.
